Die Arbeitsgruppe um Marie-Madlen Pust führte zur Beantwortung dieser Fragen eine mikrobielle Metagenom-Studie auf der Basis von Shotgun-Metagenom-Sequenzierung durch. Sie sammelten dazu Hustenabstriche von 41 Patient:innen mit Mukoviszidose sowie von 52 gesunden Kontrollen im Alter zwischen 0 und sechs Jahren. Bei der Probennahme hatten die Kinder ein medianes Alter von 26 Monaten (CF) vs. elf Monaten (Kontrollen). Es konnte eine longitudinale Kohorte von elf CF-Patient: innen eingeschlossen werden, die durch das Neugeborenen-Screening identifiziert wurden: Über einen Zeitraum von 13 Monaten wurden 36 konsekutive Proben mit einer mittleren Anzahl von 3,2 Proben pro Patient:in gesammelt. Geringe Mengen von Bakterien aus der Gattung Veillonella wurden von Anfang an in beiden Kohorten beobachtet. In den ersten vier Lebensjahren waren die relativen Abundanzmuster der Kernspezies zwischen CF- und gesunden Kindern ähnlich. Insgesamt nahmen die relativen Häufigkeiten von Streptococcus spp. mit dem Alter ab, die relativen Häufigkeiten von P. melaninogenica, P. jejuni, Veillonella parvula, Veillonella atypica, Neisseria spp. und Haemophilus spp. jedoch zu.
Nach einem Alter von vier Jahren nahm die Anzahl der Spezies mit signifikant höherer relativer Abundanz bei gesunden Kindern zu, in der CF-Gruppe konnte keine Bakterienspezies mit höherer relativer Häufigkeit im Vergleich zu gesunden Kleinkindern nachgewiesen werden. VW